الكامل الانسان الجينوم تم الانتهاء من تسلسل اثنين من الكروموسومات X والجسيمات الذاتية من خط الخلايا المشتقة من الأنسجة الأنثوية. وهذا يشمل 8% من الجينوم التسلسل الذي كان مفقودًا في المسودة الأصلية التي صدرت في عام 2001.
الكامل الانسان الجينوم تم الكشف عن تسلسل 3.055 مليار زوج أساسي من قبل اتحاد التيلومير إلى التيلومير (T2T). وهذا يمثل أكبر تحسن في الانسان مرجع الجينوم صدر في عام 2001 من قبل شركة Celera Genomics and the International الانسان الجينوم اتحاد التسلسل. الذي - التي الجينوم غطى التسلسل معظم المناطق الحقيقية اللون مع استبعاد مناطق الكروماتين المتغاير أو التمثيل الخاطئ. وتمثل هذه المناطق 8% من الانسان الجينوم الذي تم الكشف عنه أخيرا. مرجع T2T-CHM13 الجديد1 يتضمن تسلسلًا كاملاً لجميع الجينات الـ 22 بالإضافة إلى الكروموسوم X. وقد قام هذا التسلسل المرجعي الجديد أيضًا بتصحيح العديد من الأخطاء ، وإضافة ما يقرب من 200 مليون نقطة أساس من التسلسلات الجديدة التي تحتوي على 2,226 نسخة جينية ، منها 115 من المتوقع أن تكون ترميزًا بروتينيًا.
كان الجينوم المرجعي GRCh38.p13 الحالي نتيجة لتحديثين رئيسيين، أحدهما في عام 2013 والآخر في عام 2019 على تسلسل جينوم سيليرا لعام 2001. ومع ذلك، لا يزال لديه 151 مليون زوج أساسي من التسلسل غير المعروف الموزع في جميع أنحاء العالم الجينوم، بما في ذلك المناطق المحيطة بالمركز والتيلومير الفرعية، والازدواجية، ومصفوفات الحمض النووي الريبوسومي (rDNA)، وكلها ضرورية للعمليات الخلوية الأساسية. تمت تسمية المرجع الجديد باسم T2T-CHM13 لأنه يأتي من تسلسل الحمض النووي من خط خلايا CHM13 (الخلد المائي الكامل) ويتم تنفيذه بواسطة اتحاد T2T. يُشتق الخط الخلوي من بويضة مخصبة غير طبيعية أو من فرط نمو أنسجة من المشيمة حيث تبدو المرأة حاملاً (حمل كاذب)، وبالتالي فإن التسلسل يمثل فقط اثنين من الكروموسومات X والصبغيات الجسدية للأنثى. تم استخدام تقنيات تسلسل متعددة مثل أجهزة تسلسل PacBio وOxford Nanopore و100X و70X Illumina على سبيل المثال لا الحصر. وقد أدى التقدم التكنولوجي في التسلسل إلى تحديد تسلسل الـ 8% المتبقية كما هو مذكور أعلاه.
القيد الوحيد لتسلسل T2T-CHM13 هو عدم وجود كروموسوم Y. هذا التسلسل قيد التنفيذ حاليًا ، باستخدام الحمض النووي من خط خلية HG002 ، والذي يحتوي على 46 (23 زوجًا) مع النمط النووي XY. سيتم بعد ذلك تجميع التسلسل باستخدام نفس الأساليب المطورة لجينوم CHM13 متماثل اللواقح.
توافر T2T-CHM13 كمرجع جديد الجينوم يمثل اختراقًا كبيرًا سيساعد في فهم دور مناطق الكروماتين المتغاير ويساعد على فهم آثارها على العمليات الخلوية بمزيد من التفصيل. حتى اكتمال تسلسل الكروموسوم Y ، سيكون هذا بمثابة الجينوم المرجعي للدراسات المستقبلية في فهم العمليات والوظائف الخلوية.
***
مراجع حسابات
- نورك إس، كورين إس، ري أ، راوتياينن إم، بزيكادزه إيه في، ميخينكو إيه وآخرون. التسلسل الكامل لـ أ الانسان الجينوم bioRxiv 2021.05.26.445798؛ معرف الهوية الرقمي: https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
***
